很多人担心EFI这种开放的模式将会导致新的安全隐患，因为EFI系统比传统的BIOS更易于受到计算机病毒的攻击，当一部分EFI驱动程序被破坏时，系统有可能面临无法引导的情况。实际上，系统引导所依赖的EFI驱动部分通常都不会存放在EFI的GUID分区中，即使分区中的驱动程序遭到破坏，也可以用简单的方法得到恢复，因为只读芯片中的EFI代码足够用来引导计算机冲光驱启动，此时插入EFI的安装盘，对EFI的系统存储区域进行修复或者覆盖安装，就能将PC恢复到正常。而且这个修复过程对操作系统来说，等于是从两台配置一模一样配置机器中的一台转移到另一台，并不会出现需要重新识别硬件的情况。
EFI在概念上非常类似于一个低等级的操作系统，并且具有操控所有硬件资源的能力。不少人感觉它的不断发展将有可能代替现代的操作系统。事实上，EFI的缔造者们在第一版规范出台时就将EFI的能力限制于不足以威胁操作系统的统治地位。首先，它只是硬件和操作系统间的接口规范；其次，EFI环境下不提供中断的访问机制，也就是说每个EFI驱动程序必须用轮询的方式来检查硬件状态，并且需要以解释的方式运行，较操作系统下的驱动效率低得多；第三，EFI系统不提供复杂的存储器保护功能，它只具备简单的存储器管理机制，具体来说就是指运行在x86处理器的段保护模式下，以最大寻址能力为限把存储器分为一个平坦的段，所有的程序都有权限存取任何一段位置，并不提供真实的保护服务。小熊在线www.beareyes.com.cn
EFI的命令行控制模式
EFI的设计架构中，一旦引导软件将控制权交给操作系统，所有用于引导的服务代码将全部停止工作，部分运行时代服务程序还可以继续工作，以便于操作系统一时无法找到特定设备的驱动程序时，该设备还可以继续被使用。EFI的程序只限于类似Java伪执行文件的能力，并没有直接访问磁盘所有资源的能力，而且在进入操作系统后的大多数情况下，EFI部分的代码都进入沉睡模式，即使有针对EFI的病毒，也无法造成进一步的影响。小熊在线www.beareyes.com.cn
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